Trotz der über weite Strecken bessern Leistung und trotz zweimaliger Führung reichte es für den FC St. Pauli zum Auftakt der Rückrunde nur zu einem 2:2 (1:0) gegen den SC Freiburg.

Im ausverkauften Millerntor-Stadion sorgten Marius Ebbers (13. Minute) und Gerald Asamoah (68.) für die zweimalige Führung der Freibeuter. Jedoch konnte Torjäger Papiss Cissé (61./75.) mit seinem 14. und 15. Saisontreffer jedes Mal ausgleichen.